Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Polr2eQ80UW8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms