Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Bbs12-202ENSMUST00000108121 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm12792-201ENSMUST00000117669 1019 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ClmQ7TSN2 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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