Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtifQ6PEE2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms