Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Sohlh1Q6IUP1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms