Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ric1Q69ZJ7 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ric1Q69ZJ7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms