Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sbno1Q689Z5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sbno1Q689Z5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Sbno1Q689Z5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Sbno1Q689Z5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sbno1Q689Z5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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