Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Phox2aQ62066 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms