Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Grik1Q60934 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Grik1Q60934 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Grik1Q60934 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Grik1Q60934 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Grik1Q60934 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Grik1Q60934 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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