Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Sft2d1Q5SSN7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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