Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fchsd2Q3USJ8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms