Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Elf3Q3UPW2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms