Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tmem253Q3UNB8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tmem253Q3UNB8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tmem253Q3UNB8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tmem253Q3UNB8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Tmem253Q3UNB8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Tmem253Q3UNB8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem253Q3UNB8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Tmem253Q3UNB8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem253Q3UNB8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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