Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Q3U1D9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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