Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccndbp1Q3TVC7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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