Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Fndc4Q3TR08 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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