Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ccbe1Q3MI99 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ccbe1Q3MI99 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ccbe1Q3MI99 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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