Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HmgcrQ01237 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms