Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms