Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CgnP59242 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CgnP59242 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CgnP59242 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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