Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms