Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
NapbP28663 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms