Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rpl3P27659 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms