Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pde6bP23440 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pde6bP23440 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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