Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PdgfaP20033 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
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PdgfaP20033 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PdgfaP20033 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PdgfaP20033 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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