Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnnc1P19123 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms