Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
Vpreb2P13373 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Vpreb2P13373 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms