Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Cxcl1P12850 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cxcl1P12850 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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