Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxd4P10628 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms