Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P10404 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
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P10404 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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P10404 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P10404 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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