Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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