Protein–RNA interactions for Protein: P02301

H3f3c, Histone H3.3C, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3cP02301 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H3f3cP02301 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms