Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CcnkO88874 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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