Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vamp4O70480 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vamp4O70480 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms