Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Prrt1O35449 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Prrt1O35449 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Prrt1O35449 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Prrt1O35449 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Prrt1O35449 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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