Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Slc18a3O35304 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms