Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2056J3QQ02 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms