Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm3415J3QMS8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms