Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm6594J3QM43 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms