Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Gm21060J3KMU4 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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