Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Susd1E9Q3H4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms