Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc6D3YZP9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc6D3YZP9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms