Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Clip3B9EHT4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Clip3B9EHT4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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