Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Olfr622-201ENSMUST00000058744 1105 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gin1-202ENSMUST00000112842 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Apba1B2RUJ5 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms