Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Brpf1B2RRD7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms