Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NhsB1AV60 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NhsB1AV60 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms