Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Grik3B1AS29 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms