Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
H2-M5A7VMS3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms