Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtf1A2AQ19 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rtf1A2AQ19 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtf1A2AQ19 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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