Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Syndig1A2ANU3 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Syndig1A2ANU3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms