Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
VirmaA2AIV2 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VirmaA2AIV2 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VirmaA2AIV2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VirmaA2AIV2 Gm27675-201ENSMUST00000184527 94 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VirmaA2AIV2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VirmaA2AIV2 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
VirmaA2AIV2 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VirmaA2AIV2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 AA623943-201ENSMUST00000121794 354 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
VirmaA2AIV2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms